NicoWatch Toolsの記事コメントで
flvplayer_wrapperに対応してもらえないかとの要望があったので、
対応の報告ついでにつらつら書いちゃいます。
とりあえず、今回初めて
flvplayer_wrapperを使ったのですが
なんかもう・・・すごいと便利の二言しかありませんね。
自分にはここまでできるスキルが無いのでうらやましいです^^
ただ、コメントの検索機能とかは無いみたい・・・たぶん。
※ここから先は、分かる人向け
さてさて本題へ。
そもそもNicoWatch Toolsは、負荷軽減のため起動時にニコニコ動画flvplayer内のある特定の変数から情報を取得するようにしています。
flvplayer_wrapperのswfを逆コンパイルして中を覗いてみたのですが、
どうやらflvplayer_wrapperではその変数名が違うらしく、これがflvplayer_wrapperで動かない理由でした。

オリジナルでは変数"o"にフィルター情報やflv、コメントデータURL等が含まれています。

flvplayer_wrapperでは、これが"nico.o"になってました。
ちなみに"o"の変数には”base”という値が入っているようなので、これを利用して
ユーザーがflvplayer_wrapperかオリジナルかを判別することで対応できました。
まぁ、すんなり解決できたのでよかったよかった。ε-(´∀`*)